C’est à la fin du XVIIe siècle que les Bonaparte s’installent dans une partie de la maison qui depuis porte leur nom. Peu à peu ils essaient de s’attribuer la maison toute entière, étage par étage et même pièce par pièce car la coutume corse subdivise alors la propriété à un point extrême.
La maison est classée Monument Historique et devient musée national en 1967. Aujourd’hui rattachée au musée national du château de Malmaison, elle est entièrement dédiée au plus célèbre des Corses.