Le musée est installé dans le bâtiment des Petites Ecoles construit en 1651-1652 par les Solitaires pour accueillir une partie de leurs élèves. A l’intérieur, gravures, livres anciens, portraits et ouvrages de tous ceux qui participèrent à ce mouvement d’idées qui fut surtout un drame de la conscience religieuse de l’époque, organisé autour de la question centrale du libre arbitre, Port-Royal et le jansénisme.