Le musée propose, chaque année, plusieurs grandes manifestations (mai/août et octobre/décembre) dans la salle d’exposition temporaire située dans la chapelle des Sœurs du Christ.
Aujourd’hui les réserves du musée – plusieurs milliers d’objets – comprennent de riches collections d’art sacré, de beaux-arts, d’archéologie, d’art et traditions populaires ainsi que le fonds d’atelier de l’ancienne manufacture d’orgue Puget unique en Midi-Pyrénées.